「虹の幼稚園」は、虹の足を越えて、先に行った子犬の友達が世界のすべてのペットに浮かぶ話です。

子犬別に去った友人たちがしばらく滞在する「虹幼稚園」

ここに主人公であり、新入生の「シュハ」が入ってきて、幼稚園の友達「コショウ、豆腐、チョコ、豆」と出会うことになります。

これらの5人の友達それぞれが地球ごとにペットと経験した思い出、傷をそれぞれの方法で解いていく成長ストーリーです。